ভাইরাস ও ভিরয়েড উভয়ই অণুজীবজনিত সংক্রামক কণিকা, তবে তাদের গঠন ও উপাদানে স্পষ্ট পার্থক্য রয়েছে। ভাইরাসের তুলনায় ভিরয়েড অনেক সহজ গঠনের এবং কেবল RNA দ্বারা গঠিত।

• ভাইরাসে থাকে DNA বা RNA, যা একটি প্রোটিন আবরণ (capsid) দ্বারা আবৃত থাকে।

• ভিরয়েডে থাকে শুধুমাত্র একক-সুতো RNA (single-stranded RNA), কিন্তু কোনো প্রোটিন আবরণ থাকে না।

• ভাইরাস উদ্ভিদ, প্রাণী ও ব্যাকটেরিয়া—সব ধরনের জীবকে সংক্রমিত করতে পারে, কিন্তু ভিরয়েড শুধুমাত্র উদ্ভিদকে সংক্রমিত করে।

• গঠনগতভাবে ভাইরাস জটিল ও সংগঠিত, আর ভিরয়েড অত্যন্ত সরল ও ক্ষুদ্র।

মূল পার্থক্য: ভাইরাসে প্রোটিন আবরণ থাকে, কিন্তু ভিরয়েডে প্রোটিন আবরণ থাকে না।